2020-04-28, 00:46
Ciao a tutti sono nuova e pure l'argomento è nuovo per me.
vi spiego: Studiato e analizzato un network di proteine, a questo elaborato devo aggiungere argomenti di biochimica tra cui la equazione di Michaelis-Menten.
Ora, considerando che ho un file .sif della interazione necessario per ricreare il network, non so proprio come inserire il resto.
Questa equazione studia la velocità di reazione tra enzima e substrato.
Avendo un elevato numero di proteine come mi consigliare procedere?
Devo capire quali valori del network possano servire per il calcolo dell'equazione.
Ho letto che le km e Vmax sono difficili da reperire e che pertanto si ricorre all'utilizzo del piano di Lineweaver e Burk, o doppi reciproci (interpolazione dei dati a mezzo della regressione lineare).
I dati mi pare siano 1/Vmax e 1/km ? Non li ho.
Considerando che l'elaborato che ho realizzato permette lo studio di diversi file in interazione proteica, non avrò sempre le medesime proteine e lo stesso numero.
Mi chiedevo se i valori ottenuti (proprietà del network), per ciascuna proteina, possano essere utlizzati al fine del calcolo dell'equazione.
Inoltre mi chiedevo, l'equazione dev'essere calcolata e visualizzata per ciascuna proteina? Sono piuttosto confusa su come procedere.
Ho letto che si usano le espressioni di velocità Michaelis-Menten per modellare le reti di interazione proteica.
Mi potreste spiegare come? Grazie!!!!
vi spiego: Studiato e analizzato un network di proteine, a questo elaborato devo aggiungere argomenti di biochimica tra cui la equazione di Michaelis-Menten.
Ora, considerando che ho un file .sif della interazione necessario per ricreare il network, non so proprio come inserire il resto.
Questa equazione studia la velocità di reazione tra enzima e substrato.
Avendo un elevato numero di proteine come mi consigliare procedere?
Devo capire quali valori del network possano servire per il calcolo dell'equazione.
Ho letto che le km e Vmax sono difficili da reperire e che pertanto si ricorre all'utilizzo del piano di Lineweaver e Burk, o doppi reciproci (interpolazione dei dati a mezzo della regressione lineare).
I dati mi pare siano 1/Vmax e 1/km ? Non li ho.
Considerando che l'elaborato che ho realizzato permette lo studio di diversi file in interazione proteica, non avrò sempre le medesime proteine e lo stesso numero.
Mi chiedevo se i valori ottenuti (proprietà del network), per ciascuna proteina, possano essere utlizzati al fine del calcolo dell'equazione.
Inoltre mi chiedevo, l'equazione dev'essere calcolata e visualizzata per ciascuna proteina? Sono piuttosto confusa su come procedere.
Ho letto che si usano le espressioni di velocità Michaelis-Menten per modellare le reti di interazione proteica.
Mi potreste spiegare come? Grazie!!!!
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